É o seguinte, no geral, vc deve criar um script assim:
case $1 in
´start´

#Comando para iniciar
touch /var/lock/subsys/$0
#Note que esse "$0" é para pegar o nome exato do arquivo
;;
´stop´

#Comando para parar
rm -f /var/lock/subsys/$0
;;
esac
Aí vc salva ele no /etc/init.d e cria os seguintes links:
ln -s /etc/init.d/arquivo /etc/rc.d/rc0.d/K40arquivo
ln -s /etc/init.d/arquivo /etc/rc.d/rc6.d/K40arquivo
ln -s /etc/init.d/arquivo /etc/rc.d/rc3.d/S99arquivo
ln -s /etc/init.d/arquivo /etc/rc.d/rc5.d/S99arquivo
Ok????