Olha, não tou falando que a placa mãe seja fraquinha... mas pode ser um problema no hardware mesmo, alguma malfunção, ou coisa do tipo.
Com 486 você roteia dados prá altos 20 computadores (um 486 faz 200mbps nos barramentos ISA (mais ainda com os pci que sairam).
Prá ver overhead seria o uptime
Hmmm talvez um iptraf ou um tcpdump -n -i ethN também seja de alguma ajuda.
Arranca o cabo da rede interna, vê se sua máquina só como cliente oferece as perdas também...
Você não está naquele lance de 'duas placas de rede num switch' não, né?