Consegui a solução usando pdbedit. Para quem quiser, veja como se faz abaixo:
Abra o smb.conf e mude a linha:
passdb backend = ldapsam:ldap://127.0.0.1
para
passdb backend = ldapsam:ldap://127.0.0.1, smbpasswd
e reinicie o samba.
Agora faça o seguinte no terminal:
pdbedit -i smbpasswd -e ldapsam
Depois de importado os registros, volte a linha "passwd backend" no smb.conf para:
passdb backend = ldapsam:ldap://127.0.0.1