bom.. tudo depende de conhecer o sistema
quem trabalha com M$ diz que o samba é até bom sim! mas para ambientes de até 100, 150 funcionários.. além disso a parada desanda..
(escutei isso tem 2 semanas na empresa)
quem trabalha com LINUX diz que quem trabalha com M$ não conhece linux o suficiente para realizar configurações de desempenho no samba e na rede
(isso é o que eu PERCEBO.. porque quem trabalha com linux atualmente não é muito qualificado.. eu VEJO isso na empresa há 4 meses)
sua pesquisa será basicamente AD M$ x SAMBA+LDAP
abraços