tenho pouco conhecimento com samba funcionando em dominio...mas geralmente o usuário não pertence ao grupo root, mas sim a um grupo com o mesmo nome do usuário ou outro qualquer que você tenha criado... Tenta alterar o grupo também...
Acho que não tem muita coisa a ver mas não custa tentar ne?!
O que o lucianogf falou é bom verificar... Posta a configuração do samba...