Como você ta tentando acessar os compartilhamentos?? Utilizando nomes?? tipo: "
\\maquina1"
Se for tenta utilizando o IP no lugar do nome...
Não acho que o problema seja o iptables não, mas..
se as duas redes (192.168.1.0/24 e 10.1.1.0/24) forem "confiáveis" e não haver necessidade de restrição, libera todo o tráfego entre elas:
iptables -A FORWARD -s 192.168.1.0/24 -d 10.1.1.0/24 -j ACCEPT
iptables -A FORWARD -s 10.1.1.0/24 -d 192.168.1.0/24 -j ACCEPT
lembrando que essa regra libera somente o tráfego entre as redes, e não o acesso ao serviços disponívies nesse servidor...