Não importa a ordem dos pacotes nesse caso. O pacote só é processado por 1 canal de cada vez, então não fará diferênça a ordem a qual está sendo mostrados entre os canais. O que é importante neste caso é no canal específico (input ou prerouting ou output, etc), as regras estejam na ordem correta. No mais, na vizualização "all" não fará diferença as ordens...
Para melhro fazer isso que você sugeriu, é necessário selecionar cada cadeia individualmente e ae sim, colocar as regras da cadeia específica na ordem desejada.