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Cara, o bom do Linux é isso, se não funciona de cara, a gente fuça e faz funcionar.
seguinte, dá um:
#find / -name *nagios*
isso deve te dar o diretório onde estão os php's e scripts do nagios, seta esse diretório como um alias para /nagios no apache.
a sintaxe exata não lembro, mas usa o google.com/linux que acha.
se faz isso no arquivo /etc/apache2/sites-available/default
se não me engano é esse mesmo, se for apache 2 né, o 1.3 não conheço muito não, mas pelo que já ouvi falar acho que é no próprio httpd.conf