A restauração apartir do painel do Mkt não funciona mesmo, mas se vc abrir um terminal e restaurar via comando funciona beleza, já restaurei até da ver 2.97, mas usando o TAB ele não acha o nome do arq backup, tem que digitar. (hoje ele mostra, sei lá) Ex.: system backup load name=MikroTik-04082008-2044.
Detalhe: a única coisa que tive que fazer foi ativar ([ ]ENABLE) o proxy que veio desabilitado, no mais tudo ok.
* Sobre o uso do proxy do Mkt o problema é se não bloquear o acesso externo ao IP do proxy, fazendo isso deve funcionar 100%, se voce tiver pouca memória limita o tamanho do proxy, ex.: para 512MB de RAM limita proxy em +- 10 giga, mas é bom fazer testes e verificando como fica o uso da memória.
Espero ter ajudado.