Da uma olhada nesse link para ver se ajuda em alguma coisa.
#519246 - Cannot be install boot loader in Lenny-stable - Debian Bug report logs
Meu inglês é péssimo, mais pelo que eu intendi ele tem o mesmo problema que você.
Achei esse outro link aqui, que me parece ser um tutorial para instalar o CentOS nessa controladora Installation of CentOS 5.1 on an old machine with a SmartRAID V controller | Linux for Fun
Não sei se vai ajudar muito....