Boa tarde.
O comando /system backup gera backup binário, de conteúdo com dados mais sensíveis[1], não exportados com /export. Um exemplo desses dados é a senha dos usuários de acesso ao RouterOS (não confundir com usuários PPP ou HotSpot).
Com isso, /export acaba sendo bem menor. E ficará menor ainda, se usar o comando /export compact[2], que retorna apenas a diferença entre o que é padrão e o que você realmente modificou, tornando o código mais legível, sem sobras irrelevantes.
Lembrando que o comando /export compact está apenas disponível nas versões 5.12 (ou maior) do RouterOS.
[1] http://wiki.mikrotik.com/wiki/Manual...nt#Description
[2] http://wiki.mikrotik.com/wiki/Manual...Compact_Export
Saudações,
Trober
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