Estou com o mesmo problema.
Tenho dois servidores com samba, um na versão 3.0.2 e outro na versão 2.0.3.
Temos um padrão de maquinas com o Windows NT 4. Mas também temos maquinas com Windows XP SP1 e SP2.
Temos problemas ao gravar arquivos no Samba 2.0.3, pois os arquivos após atualizada a pasta aparecem novamente. Isso não ocorre utilizando o samba 3.0.2. Isso ocorre apenas utilizando as maquinas clientes que estão utilizando o Windows XP com Service Pack 2.
Service Pack 1 ele apaga normalmente, assim como no Windows NT 4 e no Windows 2000.
C você tiver alguma solução para isso entraria em contato comigo?
Valeu
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XP nao apaga arquivos no samba-2.0.3
Nosso problema tem exatamente as mesmas características do seu. Estamos pesquisando o assunto, manteremos o forum atualizado.