Isso é porque o cliente fechou o túnel e o abriu novamente, certamente devido a falhas de conexão (muita perda de pacotes) no túnel. O cliente faz isso para tentar fazer o túnel voltar a funcionar, pois ele não sabe se o problema é qualquer outro, ele acha que é o túnel que deu problema.

Ja no seu mikrotik, você certamente deve estar com a opção "Keep alive timeout" sem valor nenhum, desativando o envio de "pings" para o túnel para testes. Com essa opção desativada, o MK não testa o túnel para ver se ele ta funcionando, e como o cliente ja fechou ele a abriu outro, ele vai ficar eternamente lá, sem uso, e você acaba com varias interfaces pppoe-server-binding, tipo assim:

pppoe-joao
pppoe-joao-1
pppoe-joeo-2

Cada vez que deu problema de comunicação, que o cliente achou que o túnel deu problema, ele o fechou e abriu outro, porém, o MK não recebeu o PADT (mensagem para terminar a conexão do túnel), e acha que ele ainda está aberto, e como ja falei, sem o Keep Alive timeout, ele não verifica e ficam interfaces sem uso sobrando lá.

Esse problema não é no PPPoE em sí, é certamente em alguma outra parte da sua rede, que está dando problemas temporários de comunicação fazendo o cliente achar que o túnel caiu.

Eu tenho disso aqui também, infelizmente.
Eu deixo a opção Keep alive timeout ativa em 10s, para não ficar com mtos túneis PPPoE sobrando sem uso.