Olá,
Poxa... são muitas as dúvidas, mas vamos às duas mais importantes.
1) Como devo configurar as permissões dos diretórios deixados no /etc/skel que serão utilizados pelos usuários novos?
2) Onde fica o arquivo em que informo os scipts ou programas que quero executar a cada logon (sessão)?
Valeu!