Cara, depende muito e que tipo de backup vc quer fazer.
Uma vez montei dois servidores sambas "redundantes". O cliente queria ter um backup, então eu configurei um cliente/servidor Rsync entre os dois sambas. Eles sincronizavam automaticamente durante a noite quando não tinha ninguém no escritório. Acho o Rsync interessante porque ele um backup diferencial e pode ser também em ambos os sentidos.
Mas como te disse depende do que você quer fazer...