Ajuda com intranet / Subdominio / Restrição de acesso

Boa Tarde Pessoal,

Tenho um servidor CentOS aqui na rede, onde roda um servidor apache com o site da empresa (Empresa.com.br -) rodando normalmente.
Agora me surgiu uma tarefa de criar um site que vai rodar somente na rede interna (intranet) usando o mesmo apache que roda o site, porém esse sistema/site vai rodar em outro diretório, e somente vai ter acesso os computadores da rede interna da empresa, ou seja, de fora, via internet, ninguem vai ter acesso.

A ideia seria criar um subdominio tipo intra.empresa.com.br.
Porém não sei por onde começar.. Tenho uma noção boa de uso do linux, porém esta é uma configuração que nunca fiz.

Aguardo a ajuda de vocês.

Abraços!
Ewaldo