Exportar importar Banco de Dados

Olá,

Tentei copiar uma base de dados que estava em um MySQL 4instalado em um NT para um MySQL 5 instalado em um Linux. Usei uma ferramente para exportar a base do NT, criando um arquivo .sql e depois no Linux dei um SOURCE arquivo.sql para importar. A base foi criada tudo direito só que a acentuação está um problema, faltam caracteres como o c cedilha, o a com acento agudo, etc. Repeti o processo de importação só que na criação da base de dados usei o charset latin1 e collation latin1_swedish_ci. Mas quando faço consultas a base os caracteres acentuados continuam com problemas.
Qual é a forma correta de exportar/importar base de dados para que isto não aconteca?

[]s
Caps

às vezes o problema pode estar na consulta e não na base...
O servidor de onde sai as páginas de conulta é o mesmo de onde saiam do antigo banco de dados ???
Se a consulta está sendo feita a partir de um aplicativo no seu micro local, ele (seu micro com aplicativo) está configurado para aceitar acentuação ?
O que você está usando para consultar ???