Bom, então eu não entendi nada...Seguinte, o TPROXY é um patch para o iptables que faz com que o proxy transparente seja "verdadeiramente" transparente...Vamos ao caso prático:
Você dá IP válido para seus clientes, porém, por causa do Proxy transparente, o IP que sai na navegação, ao invés de ser do seu Cliente, é o IP do seu server. Com o TPROXY, o o squid (que me parece que já suporta este módulo) mantém o mesmo IP de origem do seu cliente, porém, aproveitando o CACHE, que é o que interessa no squid.
Agora eu fiz a suposição de que você usava isso por causa de uma discussão sua com o Alexandre sobre os patchs do BALABIT (que quando eu pesquisei no google, tem uma relação com o TPROXY).
Agora então me tire a dúvida, sobre o que (BALABIT) vc estavam discutindo? :-D