Postado originalmente por
Lipse
Na verdade ele não disse que a raiz do sistema está lotada, disse que o cache do apt está lotado.
Quando baixamos pacotes pelo apt-get, eles são armazenados no diretório /var/cache/apt/archives e, a menos que haja uma configuração para isso, feita por vc ou pela distribuição debian-like que vc usa (caso não use o Debian original), eles não são removidos mesmo depois de instalados.
Para isso:
# rm -f /var/cache/apt/archives/*.deb
Há um comando do próprio apt, o "apt-get clean", mas uma vez o usei e tive alguns problemas, depois não usei mais, faço na mão mesmo.
Boa limpeza.