O que sei sobre o SQF é o que está no manual online do Mikrotik. Cara, se você cursou e ainda assim eles deixaram sem maiores explicações a coisa é complicada.
Eu sinceramente nunca notei diferença mudando o protocolo. Só citei que o SQF procura repartir por igual a banda quando chega perto do gargalo porque o manual cita.
Fiz monitoramento por bastante tempo, marcado usuários para ver se havia muita oscilação entre os que atingem o pico da banda liberada, mas não consegui chegar a uma conclusão.
Talvez porque nunca ficou com link no gargalo quando testei.