1 - Quando eu digito no meu navegador
www.site.com.br, o meu servidor de DNS (no meu caso, o virtua) vai me informar que eu devo ir até o registro.br para saber para onde esse site está apontando.
2 - No registro.br, vai me informar que esse domínio é apontado para o DNS ns1.umservidor.com.br ou, caso esse falhe, ns2.umservidor.com.br.
3 - Sabendo disso, minha conexão vai até esse umservidor.com.br e requisitar esse site. O servidor vai identificar qual diretório eu vou ler através desse domínio e então, eu vou acessar seu site.
(é um pouco mais complexo que isso, mas acho que posso resumir a grosso modo, desta maneira pra que você possa me entender).